Menonton peptida di tempat kerja

Spektroskopi 2D membolehkan "penggambaran" pergerakan protein

Perubahan struktur peptida yang sangat pesat boleh "difilmkan" oleh spektroskopi 2D. © Ruhr-Universität Bochum (RUB)
membaca dengan kuat

Protein berjaya menukar struktur mereka dan dengan itu fungsi mereka dalam pecahan kedua. Dengan bantuan teknik baru, penyelidik Zurich dan Bochum kini telah berjaya buat pertama kalinya dalam penggambaran pergerakan peptida yang sangat pantas ini - potongan protein yang pendek.

Kaedah ini juga membolehkan kita menentukan sama ada dua kumpulan molekul dalam peptida bersebelahan pada suatu masa tertentu, dan oleh itu sesuai untuk pengujian eksperimen model teori. Para penyelidik melaporkan mengenai penemuan mereka dalam isu jurnal saintifik semasa.

Gear mesin molekul

Protein adalah blok bangunan kehidupan. Bagi sebahagian besar, mereka mempunyai struktur tiga dimensi yang jelas tetapi tidak statik: protein adalah objek yang sangat dinamik yang melakukan kerja mereka sebagai 'mesin molekul'. Mereka sentiasa mengubah struktur mereka, mengikat bahan-bahan lain dan mengangkutnya ke destinasi mereka, atau meningkatkan kecekapan tindak balas kimia tertentu.

Sekiranya terdapat mikroskop untuk memvisualisasikan protein, seseorang akan mendapati bahawa atom tunggal atau kumpulan molekul dalam protein - "gear" mesin molekul - menduduki skala waktu yang tidak dapat dikekalkan dalam beberapa picoseconds (0, 000, 000, 000, 001 Seconds).

"Cahaya yang dapat mengembara jarak dari bumi ke bulan dalam satu detik, ia menciptakan dalam masa yang singkat dari picosecond hanya 0.3 mm lebar, yang sepadan dengan ketebalan tiga helai kertas, " jelas Profesor Wolfram Sander dari Ruhr-Universität Bochum (RUB), yang bersama-sama dengan rakannya, Profesor Peter Hamm dari University of Zurich, bertanggungjawab untuk hasil penyelidikan baru. Ia dipercayai mengetahui banyak tentang dinamik pesat pengiraan teori ini - namun pemerhatian dan pengujian eksperimen mereka terbukti sangat sukar. paparan

"Filem" menggunakan spektroskopi 2D

Para penyelidik kini dapat membuat perubahan peptida kecil yang sangat pantas. Mereka secara literal "memfilmkan" peptida kerana ia berubah dari satu struktur ke struktur lain.

Kaedah spektroskopik yang baru digunakan, spektroskopi inframerah inframerah dua dimensi yang dipanggil. Hal ini memungkinkan untuk menentukan sama ada dua kumpulan molekul dalam peptida secara bersebelahan bersebelahan pada suatu masa tertentu. "Teknik ini membuka tetingkap masa baru yang tidak dapat diakses untuk pemerhatian dinamik struktur biomolekul dan oleh itu membenarkan pengesahan eksperimen eksperimen secara langsung, " jelas Sander.

(idw - Ruhr-University Bochum (RUB), 23.11.2006 - DLO)